液体硅肥能减轻或消除土壤中的重金属污染，这是因为：第一，硅肥中所含的硅酸根离子与镉、汞、铅等重金属，发生了化学反应，形成新的不易被植物吸收的硅酸化合物而沉淀下来；第二，施硅肥增强了农作物根系氧化能力，氧化了镉、锰等重金属，减少了它们的溶解度，从而抑制了作物对它们的吸收，有效地防止了重金属对作物的污染。
　　液体硅肥能减轻农作物病虫害的发生，减少农药的使用量，降低产品中的农药残留；一方面硅能抑制土壤病菌，如在日光温室等设施连续种植3年以上，就会遇到霉菌等土传病菌的积累，严重影响农作物的产量与品质。使用硅肥能有效防止霉菌的存活与繁殖。另一方面，农作物吸收硅元素后，在其体内形成硅化细胞，使茎叶表面细胞壁加厚，角质层增加，从而提高防虫抗病能力。
　　液体硅肥还能减轻农作物的激素残留污染。硅肥能够增加花粉活力，在开花期使用硅肥，能增加瓜果类农作物的成果率，从而可以减少用于促进坐果的生长类激素物质的使用量。